植物免疫蛋白作为一种生物农药，其作用机理与其他许多农药不同，不是直接抑制或杀死病原物，而是通过激活植物本身潜在的免疫系统，使植物自身的抗病原物能力增强，从而少发病或不发病，少受或不受害虫侵食，使植株健康生长。
科学家们经过多年研究已经了解到，植物的免疫作用可能与人或动物的不同，属于一个原始的初级免疫反应。而且，植物的免疫是通过大致相同的路径来抵御病虫害侵入的。许多能诱导植物产生免疫抗性的物质如蛋白质、寡糖、枯草芽孢杆菌、木霉菌等所诱导的植物免疫反应路径基本一致，主要都集中在水杨酸、茉莉酸和乙烯等途径。因此，免疫诱抗剂所诱导的免疫反应具有广谱性或多功能性。
相关研究发现，植物免疫激活蛋白是一类信号传导分子，可通过不同的代谢途径实现信号传导。在植物的细胞膜上存在着许多具有识别功能的受体，当免疫激活蛋白施用在植物上，接触到植物器官的表面，与表面的膜受体蛋白结合。当膜受体蛋白识别并接受了免疫蛋白的信号传导后，诱导了植物的一系列的代谢反应。促进了植物体内的水杨酸、茉莉酸、乙烯、吲哚乙酸、植保素、抗病相关蛋白等具有杀菌抗病功能物质的合成与释放，从而达到抗病防虫的作用。由于激活蛋白本身对病菌无直接杀灭作用，因此，对环境和植物都安全，更不会引起病菌的抗药性。
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