作为微生物活菌制剂的木霉菌，有效成包括分生孢子和厚垣孢子，目前，商业化的木霉菌剂多以分生孢子为主。分生孢子培养条件宽泛，固体和液体培养基都能培养，采用液固两相发酵方法，孢子活性能达到每克10亿甚至几十亿个，但分生孢子相对不耐贮存；而木霉菌的厚垣孢子虽然具有抗逆性强、存活期长、易贮藏等优点，但是，厚垣孢子培养条件苛刻，产孢数量少，限制其商业化开发。因此，现在的木霉菌剂还是以分生孢子产品为主。研究表明，4℃贮存180天后孢子分生孢子萌发率在80%以上，360天后孢子萌发率为25%。建议木霉分生孢子储藏条件采用低温保藏方式。将木霉菌分生孢子和一些保护剂和稳定剂等混合，如二甲基二萘磺酸钠、吐温80、聚乙二醇、大豆卵磷脂和黄原胶等，制备成木霉菌可湿性粉剂，可以提高木霉菌剂的常温耐储性。测试表明，木霉菌可湿性粉剂在常温阴凉处贮藏期可达1年。木霉菌厚垣孢子菌剂活孢子数最高达1亿，上海交通大学研发的木霉厚垣孢子菌剂按照优化比例（1%孢子粉、89%载体、9.1%分散剂、0.25%稳定剂和0.65%保护剂）分别加入搅拌机，搅拌均匀，制备的木霉菌剂抽真空后，采用避光包装，产品质量稳定，货架期常温下可达到6个月，厚垣孢子含量仍然维持500万个/mL。
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