杀菌剂农药和微生物菌剂肥能不能复配使用，首先来认识了解杀菌剂农药和微生物菌剂肥的特性作用。杀菌剂农药是一种用于防治植物病害的农业化学品，它根据作用方式和化学结构主要分为在植物表面形成一层药膜、阻止病菌侵染植物的保护性杀菌剂，对病原菌有直接杀伤作用的铲除性杀菌剂与在植物感病后使用能渗入植物组织内部杀死病菌或抑制其生长的治疗性杀菌剂，以及通过诱导植物产生抗病性来抵御病原菌而不是直接杀菌的抗病激活剂?等类型。无论那种杀菌剂农药类型，它们都是通过处理植物或其周围环境来抑制病原孢子的萌发或杀死萌发的病原孢子，或可以通过渗入植物组织内部，杀死或抑制病原微生物，使病株不再受害并恢复健康，保护植物免受侵害。而微生物菌剂肥通常是指一些含有大量微生物菌株、有机质和其它养分的肥料，它是通过增殖土壤微生物的数量和种类，从而改善土壤质量，改善土壤的通气性和保水性，促进植物的根系生长和吸收养分；同时能够提高作物的抗旱能力、耐病能力和产量效益。
从上述杀菌剂农药和微生物菌剂肥的特性作用来看，杀菌剂农药是专门用来杀死细菌、真菌和藻类的化学制剂，和微生物菌剂肥复配使用会直接杀死微生物菌剂肥中的有益微生物菌，导致菌肥失效，无法发挥其作用，因此农业生产实践中杀菌剂农药和微生物菌剂肥是不能复配使用的。总之在使用微生物菌剂肥和杀菌剂农药时，一般先施用微生物菌剂肥，且最好与有机肥搭配使用，以确保土壤中有足够的有机物或腐殖质，从而促进微生物的生长、繁衍和发挥激活营养元素的作用?。然后等待一段时间再选择使用杀菌剂农药，最短也要保持在使用微生物菌剂肥后间隔48小时，再选择使用杀菌剂农药防控病害，以避免杀菌剂农药对微生物菌剂肥中有益微生物的杀灭，影响微生物菌剂肥中有益微生物正常的生长和繁殖，致使微生物菌剂肥失效，无法发挥其良好的作用。
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