芸苔素内酯使用后的效果明显，那么如何科学合理的选择使用，才能确保芸苔素内酯发挥良好的应用效果，这就要求在选择使用时注意如下的问题：
1、注意芸苔素内酯不能与除草剂复配使用。芸苔素内酯在促进植物生长、增强抗逆性方面有着显著的效果。然而它很容易被其它化学物质所破坏，其中和除草剂复配后会发生复杂的化学反应，这不仅可能导致芸苔素内酯失效，发挥不出来良好的应用效果；而且芸苔素内酯与除草剂之间的某些化学反应可能会产生新的有害物质，对作物造成不可逆的损伤，轻则减产，重则绝收。
2、注重适宜浓度。芸苔素内酯能够促进植物生长，提高产量、品质和效益；然而选择使用时要视作物生长发育状况来定，对作物营养生长过旺，造成生殖生长迟缓与果实发育不良时，再喷施芸苔素内酯，会进一步加剧营养生长，最终导致植物徒长，果实产量、品质和效益反而下降。这种情况下应该采取喷施中微量营养元素肥等控旺措施，以调整营养平衡，抑制营养生长，促进生殖生长。
3、控制好高温条件下的使用量。高温条件下容易导致植物生长旺盛，这对营养物质的需求也大大增加，此时应该注重多种营养元素的配合使用，而不是加大芸苔素内酯的用量，在于芸苔素内酯本身不具备营养元素的作用，也就难以满足植物生长的营养需求。另外高温环境下植物的蒸腾作用加剧，叶片气孔关闭，影响芸苔素内酯的吸收利用效率；同时高温环境下高浓度的芸苔素内酯更容易分解，甚至产生意外的药害，造成植物叶片灼伤，严重时影响产量、品质和效益。
4、把握好使用时机。芸苔素内酯是一种水溶性制剂，喷洒后需要一定的时间才能被植物吸收。如果喷洒后遇到中等程度以上的降雨，芸苔素内酯会被雨水冲刷掉落，降低药效，甚至完全没有作用。因此选择喷施芸苔素内酯时，一定要选择晴朗早晚或阴天不降雨的天气，保证芸苔素内酯的使用效果。
5、重视因作物选择使用。目前农药市场上主要的芸苔素内酯产品包括14-羟基甾醇芸苔素内酯、28-高芸苔素内酯、28-表高芸苔素内酯、24-表芸苔素内酯和22.23.24-混表芸苔素内酯等，尽管它们的有效成分含量高低不同、生物活性也存在差别，但在农作物生长中都具有促进植物生长、增加产量、提高品质、增强抗病性等作用。因此根据作物的不同，选择合适的芸苔素内酯种类，可以避免资源浪费，节约使用成本，最大程度地发挥出芸苔素内酯的良好作用。
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