作物缺锰时，首先在新生叶脉间失绿黄化，而叶脉和叶脉附近仍保持绿色，脉纹较清晰。严重缺锰时叶面脉间出现黑褐色细小斑点，进而斑点增多扩大，布及整个叶片。不同作物缺锰的症状及易发部位有所不同。
1、蔬菜：一般从上部叶片开始，叶片脉间褪淡逐渐呈黄化叶，并出现褐色斑点或灰色等杂色斑，叶脉仍保持绿色，这些症状对光观察较为明显。番茄缺锰早期就在叶面上出现小褐点，茎叶浅绿色，叶面上生有许多小泡，渐渐扩大褪色，叶片两侧上卷，果实小。黄瓜缺锰，植株发育不良，节间短，上部幼叶边缘向下弯，下部叶片从叶肉开始失绿，并向叶脉扩展，而叶脉保持绿色，似一张绿色的网。其果实畸形，靠果柄一端极细，而到下部突然膨大，表皮色绿。甜菜缺锰，生育初期表现为叶片直立，叶片呈三角形，脉间有黄化斑点，称“黄斑病”。继而黄褐色斑点坏死，逐渐遍及全叶，叶缘向上卷缩，严重坏死部分脱落穿孔。
2、果树：缺锰时新叶脉间失绿，呈淡绿色或淡黄绿色，叶脉仍保持绿色，但多为暗绿色，失绿部位呈苍白色，叶片变薄，提早脱落，形成秃枝或枯梢；根尖坏死；坐果率低，果实畸形等。苹果叶呈浅绿色，有斑点，严重时，脉间变褐色并坏死。
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